若打算进行亲子鉴定，首要之事便是明确需要鉴定哪两位或哪几位之间的亲子关系。如此一来，关于亲子鉴定是与父亲做还是与母亲做的问题，自然也就有了清晰的答案。通常情况下，亲子鉴定以父亲与孩子作为鉴定对象的情形较为常见，但若母亲出于担忧孩子被抱错，或是涉及试管婴儿等特殊情况，选择与母亲进行亲子鉴定同样可行，这样得出的结果便能明确母亲与孩子之间是否存在亲子血缘关系。

那么，亲子鉴定是否只能和父亲进行呢？

答案是否定的。亲子鉴定并非只能与父亲进行，它同样可以与母亲进行，甚至父母双方一同参与鉴定也是可行的。这主要取决于需要鉴定的亲子关系具体类型。若需确认孩子与父亲的关系，则父亲必须参与鉴定；若需确认孩子与母亲的关系，则母亲必须参与其中。

亲子鉴定依据参与鉴定的对象不同，可分为二联体鉴定和三联体鉴定。二联体鉴定，即仅父母中的一方与孩子进行鉴定；而三联体鉴定，则是父母双方都与孩子共同参与鉴定。至于选择二联体亲子鉴定还是三联体亲子鉴定，委托人需结合个人具体需求以及相关机构的要求来综合决定。

实际上，大部分委托人选择与父亲进行亲子鉴定，这更多是基于个人需求的考量，并不意味着亲子鉴定只能局限于与父亲进行。例如，在上户口的过程中，如果户籍部门认为有必要证明父亲、母亲与孩子三人之间的亲子关系，那么就需要提供父母和孩子三方的亲子关系证明，即进行三联体亲子鉴定。